Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出人类排泄的微生态系统目录!

2022-02-07 01:45:44 来源:
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近日,一项刊登在International杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究并成果报告之中,来自欧洲遗传学科学实验等独立机构的地质学家们通过研究并成果将本能肠胃生物一组之中所有已知的大肠杆菌突变序列摘录并成了一个大型的在线,从而就能尽力研究并成果职员透彻即使大肠杆菌突变和蛋白之间的关联,以及其对本能心理健康的不良影响。

大肠杆菌遍布降解系统内除此以外,其并不需要产生细胞内来不良影响EVA降解、心理健康和对疾病的易感性,其如此多数以至于降解系统生物一组并成员的数量要比降解系统细胞还要多,包含大肠杆菌、寄生虫和其它生物;为了理解大肠杆菌在本能生物学之中所饰演的这两项配角,地质学家们举例来说会在科学实验之中分离并对其培养,随后在对大肠杆菌顺利完成DNADNA,然而现有很多大肠杆菌还不会在科学实验的环境之中被培养繁殖。

为了赢取这些大肠杆菌的相关接收者,研究并成果职员采取了另除此以外一种原理,他们从环境之中(比如肠胃)利用也就是说采样,随后在对整个采样之中的DNA顺利完成DNA,然后利用计算机原理对来自也就是说采样之中的数千种品种的生物体突变序列顺利完成重修,这种原理被称作昌突变序列学新技术,该新技术能作为一种替代原理对单个品种的DNA顺利完成分离和DNA。

研究并成果者Rob Finn问到,前年包含我们在内的三个独立制作团队重修了并成千上万个肠胃生物一组突变序列,而第二大的解决办法就是这些制作团队所受益的结果确实具有实际意义,以及确实能将这些结果摘录并成为一个非常全面的名册。现有研究并成果职员早已从本能肠胃之中超过4600种大肠杆菌群集之中摘录了20万个突变序列和1.7亿个细胞内序列,这种新型的在线(标准化的本能胃肠胃突变序列集合和标准化的胃肠胃细胞内索引)揭示了EVA肠胃的巨大多样性,并为再进一步顺利完成肠胃生物一组研究并成果打下基础了道路。

研究并成果者绘制显露的这个巨大的索引是生物一组研究并成果的一个重大意义,期望或将能为地质学家们提供者非常宝贵的资源来研究并成果本能肠胃生态系统之中每一种大肠杆菌所饰演的这两项配角。这项研究并成果确实,超过70%被检测到的大肠杆菌从而在科学实验之中被并成功培养过,而其在体内的活性仅仅未知,而这类大肠杆菌之中第二大的群体就是Comantemales;研究并成果者问到,碰到Comantemales如此尤其真是一个开心,这就凸显了我们的确对肠胃之中的大肠杆菌鲜为人知,我希望这个索引能尽力机器学习家和遗传学家在期望几年填补这一科学知识印显露。

该在线/索引利用的所有数据库都能在因特网资源Mgnify之中赢取,其能尽力地质学家们分析生物的突变序列数据库并且与也就是说的在线顺利完成对比;随着东亚地区研究并成果制作团队不断释显露新的在线,该索引可能会扩充到包含其它EVA肺脏的生物一组,比如皮肤或口腔结构上等肺脏。最后研究并成果者问到,这一索引的摘录期望或为生物学家和临床研究并成果职员提供者非常丰富的资源,然而研究并成果职员可能会在南美洲、东亚和非洲等代表性太低的地区发现更多新的大肠杆菌品种,现有研究并成果职员这不确实各不相同成年人之中大肠杆菌多样性的差异和变异情况。

更早显露处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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